Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RAD51Q06609 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAD51Q06609 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms