Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC02287-201ENST00000555299 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 YAE1D1-201ENST00000223273 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NONOP2-201ENST00000414613 1231 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PPP2R5C-224ENST00000556946 735 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC005197.1-201ENST00000597769 683 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC012158.1-203ENST00000488306 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GLRX-201ENST00000237858 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SMIM9-201ENST00000369529 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC068756.1-201ENST00000482003 403 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 OR7E121P-201ENST00000494533 1022 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC116903.1-201ENST00000557683 539 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC009166.1-201ENST00000570060 487 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CACNB1Q02641 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms