Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
UBE2NP61088 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
UBE2NP61088 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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