Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LIMK2P53671 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms