Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HOXC13P31276 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms