Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HOXA10P31260 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXA10P31260 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms