Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NMBRP28336 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NMBRP28336 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NMBRP28336 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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