Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FGFR3P22607 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.8 ms