Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TYMSP04818 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TYMSP04818 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms