Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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