Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LDLRP01130 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LDLRP01130 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LDLRP01130 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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