Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LDB2O43679 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LDB2O43679 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LDB2O43679 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LDB2O43679 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LDB2O43679 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LDB2O43679 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LDB2O43679 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms