Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SMAD6O43541 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms