Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
COCHO43405 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
COCHO43405 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
COCHO43405 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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