Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SOBPA7XYQ1 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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