Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CFAP20Q9Y6A4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CFAP20Q9Y6A4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CFAP20Q9Y6A4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms