Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
USP16Q9Y5T5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
USP16Q9Y5T5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
USP16Q9Y5T5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
USP16Q9Y5T5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms