Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAF6Q9Y4K3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF6Q9Y4K3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms