Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3V2

RWDD3, RWD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD3Q9Y3V2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD3Q9Y3V2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RWDD3Q9Y3V2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD3Q9Y3V2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD3Q9Y3V2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD3Q9Y3V2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RWDD3Q9Y3V2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RWDD3Q9Y3V2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RWDD3Q9Y3V2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms