Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KCNH4Q9UQ05 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KCNH4Q9UQ05 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KCNH4Q9UQ05 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms