Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGSF9BQ9UPX0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IGSF9BQ9UPX0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
IGSF9BQ9UPX0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms