Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN6

SCAF8, Protein SCAF8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8Q9UPN6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCAF8Q9UPN6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SCAF8Q9UPN6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SCAF8Q9UPN6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SCAF8Q9UPN6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms