Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
KCNH3Q9ULD8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KCNH3Q9ULD8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KCNH3Q9ULD8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms