Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PNMA3Q9UL41 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PNMA3Q9UL41 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PNMA3Q9UL41 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms