Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SIX4Q9UIU6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SIX4Q9UIU6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SIX4Q9UIU6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms