Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNTNAP2Q9UHC6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNTNAP2Q9UHC6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms