Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AFF4Q9UHB7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AFF4Q9UHB7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AFF4Q9UHB7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.4 ms