Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLIP2Q9UDT6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLIP2Q9UDT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLIP2Q9UDT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms