Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK8

MTRR, Methionine synthase reductase, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRRQ9UBK8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MTRRQ9UBK8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MTRRQ9UBK8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.8 ms