Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB6

NCDN, Neurochondrin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCDNQ9UBB6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NCDNQ9UBB6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NCDNQ9UBB6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms