Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTTNBP2NLQ9P2B4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms