Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CNTN3Q9P232 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNTN3Q9P232 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNTN3Q9P232 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms