Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM53CQ9NYF3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FAM53CQ9NYF3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FAM53CQ9NYF3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms