Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SPTLC3Q9NUV7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPTLC3Q9NUV7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SPTLC3Q9NUV7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms