Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LTBP3Q9NS15 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LTBP3Q9NS15 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LTBP3Q9NS15 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
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