Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
TULP4Q9NRJ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
TULP4Q9NRJ4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
TULP4Q9NRJ4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms