Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SH2B1Q9NRF2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SH2B1Q9NRF2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SH2B1Q9NRF2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms