Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHST12Q9NRB3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHST12Q9NRB3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHST12Q9NRB3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms