Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR97

TLR8, Toll-like receptor 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR8Q9NR97 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TLR8Q9NR97 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TLR8Q9NR97 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms