Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FSCN3Q9NQT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FSCN3Q9NQT6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FSCN3Q9NQT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms