Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC2

KCNK9, Potassium channel subfamily K member 9, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK9Q9NPC2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KCNK9Q9NPC2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KCNK9Q9NPC2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms