Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PLXNA4Q9HCM2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PLXNA4Q9HCM2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PLXNA4Q9HCM2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms