Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CCDC8Q9H0W5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC8Q9H0W5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC8Q9H0W5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms