Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NDUFAF3Q9BU61 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms