Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAGR1Q9BTK6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAGR1Q9BTK6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAGR1Q9BTK6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms