Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SHANK2-AS3Q9BTD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms