Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBGCP2Q9BSJ2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBGCP2Q9BSJ2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms