Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SIKE1Q9BRV8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SIKE1Q9BRV8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms