Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
FYCO1Q9BQS8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
FYCO1Q9BQS8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
FYCO1Q9BQS8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.06■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
FYCO1Q9BQS8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms