Protein–RNA interactions for Protein: Q99808

SLC29A1, Equilibrative nucleoside transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A1Q99808 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC29A1Q99808 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC29A1Q99808 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A1Q99808 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A1Q99808 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC29A1Q99808 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms